Silikonové katétry jsou široce používány v klinické medicíně, především pro případy potíží s močením, retence moči nebo pooperační katetrizace. Dočasná katetrizace je vhodná pro pacienty s akutní retencí moči. Za aseptických podmínek se katétr zavede močovou trubicí do močového měchýře, aby pomohl rychle vypustit moč; doba katetrizace obvykle nepřesahuje 24 hodin. Trvalá katetrizace se používá u pacientů s dlouhodobými-poruchami močení, jako je neurogenní měchýř nebo pokročilá benigní hyperplazie prostaty. K zajištění v močovém měchýři se používá silikonový katétr s balónkem, který vyžaduje každodenní čištění uretrálního otvoru a pravidelnou výměnu sáčku na sběr moči.
Výplach močového měchýře zahrnuje injekce léků, jako je fyziologický roztok nebo antibiotické roztoky, do močového měchýře prostřednictvím katétru k léčbě cystitidy nebo zabránění zablokování krevní sraženiny. Postup vyžaduje nízký-tlak, pomalé zavlažování a přísnou aseptickou techniku. Dilatace močové trubice se používá u pacientů se strikturou močové trubice, přičemž se postupně zvětšuje průměr katétru, aby se zlepšilo močení; toto musí provést kvalifikovaný lékař. Po urologické operaci je běžná pooperační drenáž. Katétr se používá ke sledování výdeje moči a snížení tlaku v močovém měchýři; odvodňovací systém musí zůstat uzavřený. Silikonové katétry mají hladký povrch, dobrou biokompatibilitu a nízké dráždění uretrální sliznice, díky čemuž jsou vhodné pro dlouhodobou-permanentní katetrizaci.
